Naším cílem je pochopit mechanismy umožňující rozmnožování virů. Studujeme, jaká je struktura virových částic a jak viry využívají infikované buňky k zajištění produkce virového potomstva. K práci používáme metody molekulární biologie, fluorescenční mikroskopie světelného listu a kryo-elektronové mikroskopie a tomografie. Hlavními objekty našeho zájmu jsou: 1) Pikornaviry – velká skupina virů způsobujících řadu onemocnění od nachlazení po záněty mozku. 2) Včelí viry, které způsobují kolapsy včelstev. 3) Bakteriofágy, které mohou být využity jako alternativa antibiotik k léčbě infekcí způsobených bakteriemi Staphylococcus aureus (zlatý stafylokok) a Pseudomonas aeruginosa. Studenti se v naší skupině mohou naučit techniky genového inženýrství, práci s bakteriemi a tkáňovými kulturami, pěstování a purifikaci virů v laboratořích BSL2 a BSL3, práci s fluorescenčním mikroskopem světelného listu a elektronovými mikroskopy. Kontakt: pavel.plevka@ceitec.muni.cz
Předmětem našeho výzkumu jsou nové formy sloučenin platiny a ruthenia s protinádorovou aktivitou. Vycházíme z metaloléčiv používaných v medicíně, které chemicky dále upravujeme, a následně studujeme jejich kombinace se systémy, obsahujícími ve své molekulární struktuře dutiny, do kterých může být léčivo zapouzdřeno. Výsledný systém neovlivňuje zdravé buňky během svého působení v lidském těle a nabízí tak možnost omezení nežádoucích vedlejších účinků doprovázející klasickou protinádorovou léčbu. Kontakt: radek.marek@ceitec.muni.cz
Začni studovat proteiny, molekuly, které vykonávají různorodé funkce v buňkách. Ve skupině Kostase Tripsianese kombinujeme biochemii, biofyziku a strukturní biologii za účelem produkce a charakterizace komponentů tzv. WNT signalizační dráhy, která je důležitá hlavně při vývoji a regeneraci organismů. Jak tyto proteiny vypadají? Mění svůj vzhled? Jsou ustálené a nebo se nepřetržitě pohybují? Mají nějaké interakční partnery, se kterými zůstávají v kontaktu? Přidej se k nám testovat hypotézy a najít odpovědi, které mohou posunout znalosti v oblasti WNT. Kontakt: kostas.tripsianes@ceitec.muni.cz
Vyvíjíme nové peptidy/bílkoviny, které lze použít k léčbě infekcí, včetně těch způsobených bakteriemi rezistentními vůči antibiotikům. Pomocí počítačových simulací zjišťujeme, jak mohou peptidy zabíjet bakterie, například vytvářením otvorů v bakteriálních membránách nebo přenášením léčiv. Na základě získaných výsledků navrhujeme nové peptidy, které experimentálně ověřujeme v naší laboratoři, a to včetně jejich toxicity a schopnosti zabíjet rezistentní bakterie. Kontakt: Robert.Vacha@ceitec.muni.cz
Zaměřujeme se na transkripční a translační procesy u bakterií a lidí. Naším hlavním přístupem je strukturní biologie, zejména kryo-elektronová mikroskopie ke stanovení struktur RNA polymerázy a ribozomových komplexů v několika fázích od iniciace po terminaci. Kromě toho používáme kryo-elektronovou tomografii, abychom přímo v lidských buňkách zkoumali, jak jsou ribozomy (proces translace) ovlivněny virovými infekcemi, zejména se zaměřením na poxviry (neštovice). Kontakt: gabriel.demo@ceitec.muni.cz
Produkce semen zemědělských plodin je zásadní pro výrobu mnoha potravin. Náš výzkum se snaží pochopit všechny aspekty, které tvorbu semen ovlivňují. Zajímá nás, jak rostliny reagují na různé podmínky prostředí, ve kterém rostou, a jak se tyto změny v podmínkách propisují do změn v regulaci na buněčné a molekulární úrovni. Snažíme se identifikovat geny, které by mohly pomoci zlepšit produkci rostlin při vysokých teplotách. Pracujeme zejména s modelovou rostlinou Arabidopsis thaliana a zemědělsky důležitou řepkou olejnou, ale využíváme i rajčata nebo mandloně. Kontakt: katerina.macova@ceitec.muni.cz
V naší laboratoři se zabýváme rozvojem metod proteomické analýzy s využitím hmotnostní spektrometrie, zejména pro analýzu post translačních modifikací proteinů (acetylace, metylace histonů, glykosylace či fosforylace). V rámci našich spoluprací poskytujeme široké spektrum proteomických aplikací pro kolegy z ČR i zahraničí, kterým naše výsledky umožňují posouvat hranice našeho poznání molekulární podstaty buněčných procesů i naplnit cíle jejich aplikovaného výzkumu. Ozvěte se a dozvíte se víc. Kontakt: zbynek.zdrahal@ceitec.muni.cz
Naše laboratoř studuje regulaci genové exprese, tj. jak se geny přepisují do RNA. V tomto procesu hrají zásadní roli dva proteiny, cyklin dependentní kináza 11 (CDK11) a 12 (CDK12), které jsou často změněny v různých typech nádorů. Používáme nejnovější metody molekulární biologie, biochemie, chemické biologie a bioinformatiky k pochopení molekulární funkce těchto proteinů v normálních a rakovinných buňkách. Tyto znalosti využíváme také při navrhování nových protinádorových strategií. Kontakt: dalibor.blazek@ceitec.muni.cz
Chcete poznat, co všechno dokáže molekula RNA v lidských buňkách? Chcete se podílet na odhalení dosud neznámých mechanismů, které zajišťují správné fungování našich buněk? Chcete se naučit jak geneticky modifikovat lidské buňky pomocí genetických nůžek CRISPR-Cas, připravit fluoreskující proteiny či odhalovat další tajemství RNA? Přijd’te se informovat k nám. Jsme mezinárodní tým studentů a postdoků, kteří s odhalují dosud neznámé aspekty RNA biologie. Kontakt: stepanka.vanacova@ceitec.muni.cz
Studujeme různé typy leukémií a lymfomů vznikajících z tzv. B-lymfocytů - buněk imunitního systému. Pomocí in vitro modelů, sekvenování nové generace a vzorků od pacientů léčených v sousední fakultní nemocnici dešifrujeme molekulární mechanismy regulující vznik a progresi těchto onemocnění a vyvíjíme léčebné strategie a diagnostické nástroje (včetně několika patentů). Například jsme ukázali, že nekódující RNA hrají zásadní roli u leukémií/lymfomů a popsali jsme nové mechanismy rezistence na léčbu. Kontakt: marek.mraz@ceitec.muni.cz
Zaměřujeme se na dvě hlavní hematologické malignity, tj. onemocnění zhoubným nádorem – chronickou lymfocytární leukemii a akutní myeloidní leukemii, jejichž léčba často selhává, a chceme dosáhnout lepší léčby. Používáme „molekulární nůžky“ CRISPR/Cas9 k vytváření nových buněčných modelů nesoucích mutace pacientů, k charakterizaci mechanismů rezistence na současnou léčbu nebo k identifikaci nových cílů pro terapii. Testujeme velkou sbírku léků, abychom objevili nové účinné terapie, a využíváme moderní genomické přístupy k odhalení mechanismů. Kontakt: michal.smida@ceitec.muni.cz
Láká Vás podívat se na molekulu DNA, zda má opravdu strukturu šroubovice; sestavit model srdce a testovat na něm nová léčiva; pomoci pacientům s artrózou, nebo vylepšit kloubní implantáty, aby je pacienti lépe přijímali; anebo sestavit model buněčné membrány a studovat tak pochody na této buněčné hranici? Fascinuje Vás umělá inteligence, která nám může pomoci zpracovávat velké množství dat a získat tak nový vhled a informace o studovaných objektech, nebo počítačové zpracování obrázků, které umožňuje zachycení více detailů a kvalitní zobrazení? Naše laboratoř Vás ráda zapojí. Pojďme se společně podívat za hranice mikrosvěta. Kontakt: jan.pribyl@ceitec.muni.cz
Připojte se k nám v naší BioIT sdílené laboratoři a objevte vzrušení z bioinformatiky, když se ponoříte do labyrintu genetického kódu s využitím vašich informatických schopností při analýze dat získaných sekvenováním nové generace (NGS). Uplatněte své teoretické znalosti informatiky a matematiky v praxi a zapojte se do důležitých projektů molekulární medicíny s přímým dopadem na zdraví pacientů. Kontakt: vojtech.bystry@ceitec.muni.cz
Profily výzkumných skupin a sdílených laboratoří, které aktuálně nabízejí stáže, si můžete stáhnout také ve formátu pdf přes tlačítko níže.
MU
